ジョーカーが死して半年――。
夜ごと悪夢にさいなまれているブルース・ウエインを本当の悪夢に陥れる事件が起きる。護送車から脱走したジョーカーの手下ローレンスと崇拝者がジョーカーこと、ジャック・ネイピアの墓を掘り起こし、埋葬されているのが別人であることが発覚する。ジョーカーは死んでいなかった……？　不安は現実のものとなり、ジョーカーは再び現れる。テレビ電波をジャックした彼は、銀行襲撃を予告。ゴッサムシティを再び闇が吞み込んでいく。再びバットスーツを身にまとったウェインの前に、スマイレックスによって生まれた新たな怪人が現れる。バットマンは街に平和を取り戻すことができるのか――？