幼き日、異世界に転移した少年・新垣空也【あらがきくうや】。
一見のどかに見えたその異世界は、男が謎のモンスター【憐魔】と化し、滅びつつある終末世界だった。

最後の男となった空也は、女だけが生存する大陸からやってきた少女・リルルに導かれ、彼女の住むアイト地区に到着。
本格的に人類存続をかけた子づくりを始めようとするが、不穏な影が空也に迫る…!!